Please use this identifier to cite or link to this item:
http://studentrepo.iium.edu.my/handle/123456789/10375
Full metadata record
DC Field | Value | Language |
---|---|---|
dc.contributor.advisor | Tengku Haziyamin Tengku Abdul Hamid, Ph.D | en_US |
dc.contributor.advisor | Mohd Hamzah Mohd Nasir, Ph.D | en_US |
dc.contributor.author | Alotaibi, Mohammed Abdullah | en_US |
dc.date.accessioned | 2021-02-24T06:21:14Z | - |
dc.date.available | 2021-02-24T06:21:14Z | - |
dc.date.issued | 2020 | - |
dc.identifier.uri | http://studentrepo.iium.edu.my/handle/123456789/10375 | - |
dc.description.abstract | A complex and diverse range of microorganism communities live within the gastrointestinal (GI) tract of living organisms. Amongst the bacterial communities in the GI tract, lactic acid bacteria (LAB) is generally regarded as safe, and probiotic due to their inherent benefits in improving the overall host GI tract, limiting intestinal infections, combatting pathogenic bacteria and controlling some types of cancer. In this study, 80 isolates were obtained from brain, epidermal organ, stomach and the end of intestinal tract of Blacktip shark (Carcharhinus limbatus). Preliminary inhibition test using spot-on-lawn assay was conducted to eliminate the isolate with no antagonistic activity against selected indicator strains. Out of these 80, only 4 isolates showed antagonistic activities against selected indicator strains in which they were selected for further biochemical tests such as Gram-staining, catalase, oxidase, and motility, the were found to be Gram positive coccoid shape, lactose fermentation positive, and negative to both oxidase and catalase tests. The isolates FA1, FA2, FA3 and FA4 demonstrated broad range of activity spectrum by inhibiting the Gram-positive indicator strains (Staphylococcus aureus and Bacillus cereus) and the Gram-negative indicator strains (Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, salmonella typhimurium, Vibrio alginolyticus and Vibrio parahaemolyticus); with the highest inhibition zone recorded at 20 ± 0.1 mm on V. parahaemolyticus using agar well diffusion method as a confirmatory test. The isolates were chosen for further characterization using 16S rRNA PCR amplification. Each sequence was respectively deposited in GenBank (NCBI) with an accession number: MN975529 for FA1, MN982712 for FA2, MN982711 for FA3 and MN982710 for FA4. These isolates were identified to be belonged to member of the Lactococcus lactis group with 98% homology. The cell free supernatant (CFS) of the isolates was harvested for further tests. Treatment of the CFS with pH and catalase ruled out any inhibition caused by organic acids or hydrogen peroxide (H2O2) and was considered as crude bacteriocin. Complete inactivation of the isolates CFS antimicrobial activity was observed after treatment with proteinase K, thus proving its proteinaceous nature. This is one of a very few reports on LAB strains isolated from the Blacktip shark (Carcharhinus limbatus) producing antimicrobial proteins or bacteriocin. These isolated strains could prove to be a very useful probiotic strain in aquaculture or animal feed as a mean to fight the ever-growing problem of drug resistant pathogenic bacteria as well as, promoting growth and the overall host health. | en_US |
dc.language.iso | en | en_US |
dc.publisher | Kuantan, Pahang : Kulliyyah of Science, International Islamic University Malaysia, 2020 | en_US |
dc.title | Isolation and characterization of lactic acid bacteria isolated from blacktip shark (carcharhinus limbatus) with probiotic potential | en_US |
dc.type | Master Thesis | en_US |
dc.description.identity | t11100424283MohammedAbdullahAlotaibi | en_US |
dc.description.identifier | Thesis : Isolation and characterization of lactic acid bacteria isolated from blacktip shark (carcharhinus limbatus) with probiotic potential /by Mohammed Abdullah Alotaibi | en_US |
dc.description.kulliyah | Kulliyyah of Science | en_US |
dc.description.programme | Master of Science (Biotechnology) | en_US |
dc.description.abstractarabic | تعيش مجموعة معقدة ومتنوعة من مجتمعات الكائنات الحية الدقيقة داخل الجهاز الهضمي للكائنات الحية، وتبقى هناك ضمن هذه المجتمعات التي تستعمرالجهاز الهضمي. تعتبر بكتيريا حمض اللاكتيك(LAB) وبروبيوتيك آمنة بشكل عام بسبب فوائدها في تحسين الجهاز الهضمي والحد من الالتهابات المعوية، ومكافحة البكتيريا المسببة للأمراض داخل العائلة والسيطرة على بعض أنواع السرطان. في هذه الدراسة تم الحصول على 80 عينة من الدماغ والمعدة ونهاية المسالك المعوية لقرش Blacktip (Carcharhinus limbatus). تم إجراء اختبار التثبيط الأولي باستخدام spot-on-lawn assay للقضاء على العينة مع وجود نشاط ضد البكتيريا المختارة كمؤشر. من بين 80 عينة فقط أظهرت 4 أنشطة معاكسة ضد البكتيريا المختارة كمؤشر. تم اختيارها لمزيد من الاختبارات الكيميائية مثل صبغة الجرام ،اختبار الكاتالاز ، اختبار أوكسيديز، واختبار الحركة. تم العثور على شكل كروي الإيجابي، وتخمر اللاكتوز إيجابي، وسالب لكل من اختبارات الأكسدة والكاتالاز. أظهرت العينات FA1 و FA2 و FA3 و FA4 نطاقًا واسعًا من طيف النشاط عن طريق تثبيط البكتيريا المأخوذة كمؤشرات إيجابية الجرام Staphylococcus aureus و Bacillus cereus و سلبية الجرام و Pseudomonas aeruginosa و Salmonella typhimurium و Vibrio alginolyticus ، حيث سجلت أعلى منطقة تثبيط عند 20 سم على V. parhaemolyticus باستخدام طريقة agar well diffusion method كاختبار تأكيدي. تم اختيارالعينات لتوصيفها باستخدام 16s rRNA PCR. تم وضع التسلسل الجيني في GenBank (NCBI) مع أرقام الانضمام: FA1 MN975529 وFA2 MN982712 و FA3 MN982711 و FA4 MN982710. وبالتالي، تم تحديد العينات بشكل إيجابي كأعضاء في مجموعةLactococcus lactis بنسبة 98 ٪ من التماثل. تم جمع (CFS) لمزيد من الاختبارات. استبعد علاج CFS مع (H2O2) والكاتالاز الناجم عن الأحماض العضوية أو بيروكسيد الهيدروجين (H2O2) واعتبر بكتيريوسين خاماً . لوحظ إبطال نشاط عينات CFS المضادة للميكروبات بعد المعالجة بالبروتيناز k ، مما يثبت طبيعتها البروتينية. أنتجت هذه السلالات من الكائنات الحية المجهرية المأخوذة من سمك القرش الأسود (Carcharhinus limbatus) بروتينًا مضادًا للميكروبات أو بكتيريوسين. يمكن أن تكون هذه السلالات المعزولة سلالة بروبيوتيك مفيدة للغاية في تربية الأحياء المائية أو الأعلاف الحيوانية كوسيلة لمكافحة المشكلة المتزايدة باستمرار للبكتيريا المسببة للأمراض المقاومة للأدوية، وكذلك لتعزيز النمو والصحة العامة للعائل . | en_US |
dc.description.notes | Thesis (MSBTS)--International Islamic University Malaysia, 2020. | en_US |
dc.description.physicaldescription | xiv, 107 leaves : colour illustrations ; 30cm. | en_US |
item.openairetype | Master Thesis | - |
item.grantfulltext | open | - |
item.fulltext | With Fulltext | - |
item.languageiso639-1 | en | - |
item.openairecristype | http://purl.org/coar/resource_type/c_18cf | - |
item.cerifentitytype | Publications | - |
Appears in Collections: | KOS Thesis |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
t11100424283MohammedAbdullahAlotaibi_24.pdf | 24 pages file | 374.28 kB | Adobe PDF | View/Open |
t11100424283MohammedAbdullahAlotaibi_SEC.pdf Restricted Access | Full text secured file | 2.69 MB | Adobe PDF | View/Open Request a copy |
Page view(s)
20
checked on May 17, 2021
Download(s)
4
checked on May 17, 2021
Google ScholarTM
Check
Items in this repository are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated. Please give due acknowledgement and credits to the original authors and IIUM where applicable. No items shall be used for commercialization purposes except with written consent from the author.